民国初年，吐鲁番直隶厅改为吐鲁番县，辖今吐鲁番、托克逊两地，隶属迪化道。民国9年(1920)后，划归焉耆行政长官管辖。民国28年(1939)，吐鲁番地区重归迪化区行政长官公署、迪化区行政督察专员公署管辖，领吐鲁番、托克逊两县。吐鲁番郡王统治也一直沿袭下来。

　　在1884年新疆建省以前，额敏和卓家族在吐鲁番实行封建农奴制度。建省后在吐鲁番实行“改土归流”政策，废除郡王家族的农奴制，将农奴变成佃农，郡王家族仍拥有大量土地、牲畜，并征收赋税和征用摇役，实行政教合一的封建统治特权。到1949年之前，吐鲁番郡王已演变为一个封建地主，对农民实行剥削的方式变为雇工制和实物地租。随着王权的日益衰落，过去农奴制经济残余已不复存在，只保存着封建地主经济形式。

　　1949年以后，吐鲁番、鄯善和托克逊3县废除了保甲制，建立乡、村人民政权。1950年起，3县隶属迪化专员公署、乌鲁木齐专署。1958年撤销乌鲁木齐专署建制，属自治区直属县。1969年归乌鲁木齐市管辖。1970年起吐鲁番县和托克逊县隶属乌鲁木齐市，鄯善县划归哈密专区。1975年成立吐鲁番地区，辖吐鲁番、托克逊、鄯善3县。1985年，吐鲁番县撤县设市，仍归吐鲁番地区领导。

　　吐鲁番地区设置一市两县，即吐鲁番市、鄯善县、托克逊县。市县以下，辖10个镇、17个乡、两个街道办事处、218个行政村。

　　据1995年统计，吐鲁番地区的总人口为535475人，其中吐鲁番市2391仍人，鄯善县194362人，托克逊县102007人。  

　　 全地区各少数民族人口412238人，占地区总人口的77％。吐鲁番是一个多民族聚居的地区，约有30个民族在这里共同生活。人数最多的民族是维吾尔族，376611人；其次是汉族，123237人。占第三位的是回族，34466人。其他民族人数都很少，有些民族人数少于5人。

　　吐鲁番素有“长寿之乡”的称号，据1990年统计，仅吐鲁番市80岁以上老人共951人，百岁老人12人。这些百岁老人均为维吾尔族，全部住在农村。