姑师人和车师前国早在六七千年前，吐鲁番盆地就有了人类活动，并已开始进入新石器时代。无论是在阿斯塔那一哈拉和卓，还是在雅尔湖和艾丁湖，都发现过新石器时代的遗址和遗物。为了采集和狩猎，以维持生存，原始社会时期的吐鲁番人已经学会打磨和使用细石叶石器及石矛、石刀，还会用穿孔的小砾石作装饰，并能制造彩绘陶器，人类生活确切无疑地在吐鲁番盆地展开了。 

　　距今约3000年，随着人类社会的发展，游牧的人们逐渐定居下来，生产方式也从以采集、狩猎为主向以农业为主转变。在古墓葬中出现了大量的夫妻合葬墓，随葬品有很大的差异，贵族墓葬中殉葬的马和骆驼达数十只，而一般人的墓葬中仅放一个羊头或一块羊排骨。

　　据史料记载，吐鲁番盆地的土著民族是姑师(后称车师)人，他们早在2200年前就进人了文明社会，建立了自己的国家，有了王城。姑师人以吐鲁番盆地为中心，活跃在罗布泊以 东以北至天山北部的乌鲁木齐、吉木萨尔和巴里坤一带广阔地区。公元前2世纪的姑师，臣属于匈奴。姑师人建立的姑师国(后称车师前国)，人口约6000人，如果包括建立在吐鲁番盆地一带的山国、孤胡国、车师都尉国、车师后城长国等小国，再加上天山以北的车师后国，人口就有两万之众了。

　　西汉初期，匈奴据有西域，对汉朝不断进行侵扰。汉武帝建元三年(前138)，张骞出使西域，联合各国以“断匈奴右臂”。但欲开辟西域通道，必须打通“姑师”之地。从此，西汉王朝与匈奴为争夺“姑师”，展开了旷日持久的你来我往的拉锯战。

　　自从汉武帝元封三年(前108)，派遣汉朝将军赵破奴等率骑数万，攻克楼兰、姑师，姑师改称车师臣属西汉之后，又数次遭匈奴控制。如此往复大战5次，至汉宣帝神爵二年(前60)，匈奴日逐王率众降汉，车师之地重为汉朝，这5次争夺车师的战争，史称“五争车师”。

　　西汉王朝在收复车师、统一西域的同时，在西域设立都护． 府。当时受命“使护鄯善”(即罗布泊西南楼兰等地)的卫司 马郑吉，大败匈奴日逐王威震西域，所以就被西汉朝廷任命为首任西域都护。从此，西域归人汉朝版图，西汉也有了统领西域的政治和军事机构。

　　车师归属西汉以后，其领域“分为车师前后王及山北六国”。其中车师前国又称车师前王庭。

　　《汉书·西域传》载曰：“车师前国，王治交河城，河水分流绕城下，故号交河，户七百，口六千五十，胜兵千八百六十五人。”后来，车师前国并吞了吐鲁番盆地的几个小国，王城交河就成为这一地区的政治经济中心。

　　汉元帝初元元年(前48)，西汉王朝在车师前国设立戊己校尉，掌管西域屯田事务。公元前21年，戊已校尉府从交河城移驻高昌壁(今高昌故城)。这一时期，中原汉人开始在吐鲁番一带定居。